，芽管逐渐延长呈丝状，称为菌丝。菌丝可长出许多分支 ，交织成团
，称菌丝体（mycelium）
。菌丝根据结构，分为有隔菌丝（有隔膜 ，将一条菌丝分隔为数个细胞）和无隔菌丝（无隔膜，一条菌丝即为一个细胞）。

根据功能
，分为营养、繁殖 、气生菌丝 。根据形态，分为结节状
、球拍状、螺旋状 、鹿角状等
。

孢子：是真菌的繁殖结构 ，是由生殖菌丝产生的一种繁殖体。真菌的孢子分为无性孢子和有性孢子两大类 。

1）无性孢子：是指不经过两个性器官或性细胞的结合而产生的孢子
。

a）叶状孢子。由菌丝细胞直接形成的生殖孢子 。有3种类型①芽生孢子②关节孢子③厚膜孢子
。

b）分生孢子。生殖菌丝末端及分支的细胞分裂或浓缩形成的单个、成簇或链状的孢子
，是多细胞真菌最常见的一种无性孢子，有大小之分 ，分为大分生孢子和小分生孢子 。

c）孢子囊孢子
。由菌丝末端形成一种囊状结构即孢子囊
，内有许多孢子称为孢子囊孢子。

2）有性孢子：是由同一菌体或不同菌体的两个细胞或性器官融合，经减数分裂所产生的孢子 。产生的有性孢子分为四类。

a）卵孢子
。在一个菌丝上生出两个配子囊 ，小的为雄器
，大的是藏卵器，二者配合 ，雄器的内容物经由受精管进卵球
，形成卵孢子。见于鞭毛菌亚门的卵菌纲 。

b）接合孢子
。两个菌丝侧枝肿胀，顶端接触结合而形成接合孢子。见于半知菌